Подлежащее — They (они). Это множественное число. Для местоимений I, you, we, they и существительных во множественном числе используется глагол have. Форма has используется только для третьего лица единственного числа (he, she, it).
Поэтому правильный вариант — have.
Ответ: They have lunch at 1 o'clock.