Предложение "Mike is ... Pete. They will both do well on the exam" сравнивает Майка и Пита.
"As clever as" (такой же умный, как) — используется для сравнения двух равных по признаку объектов.
"Cleverer than" (умнее, чем) — сравнительная степень, используется для сравнения двух объектов, когда один превосходит другого.
"Most clever" — превосходная степень, используется для сравнения трех и более объектов, когда один превосходит всех остальных.
Поскольку предложение говорит, что "они оба" (both) хорошо справятся, это подразумевает, что их уровень ума схож. Конструкция "as clever as" лучше всего подходит для выражения этого равенства.