Это вопросительное предложение с вопросительным словом 'Who' в Past Simple. Порядок слов: Вопросительное слово + Сказуемое + Подлежащее + остальные члены предложения.
Собираем всё вместе:
Who was the best pupil in your school last year?
Кто был лучшим учеником в твоей школе в прошлом году?