Нет, нельзя считать, что ртуть в закрытой бутылке, заполненной наполовину, находится только в нижней части сосуда.
Ртуть, как и любой другой газ, занимает весь доступный ей объем. В закрытой бутылке ртуть будет находиться как в жидком состоянии на дне сосуда, так и в виде паров над жидкой ртутью, заполняя верхнюю часть бутылки. Между жидкой ртутью и ее парами устанавливается динамическое равновесие, при котором скорость испарения ртути равна скорости конденсации ее паров обратно в жидкость.