Основная причина строительства Зейской ГЭС в 560 км от Благовещенска заключается в использовании реки Зея для выработки электроэнергии. Для этого необходимо наличие подходящего места для создания водохранилища и плотины. Географическое положение реки Зея и ее характеристики в районе строительства ГЭС оказались более подходящими для строительства гидроэлектростанции, чем вблизи Благовещенска. В частности, рельеф местности и геологические условия позволяли создать водохранилище нужного объема и обеспечить надежность плотины. Перенос ГЭС дальше от потребителя является обычным решением, так как передача электроэнергии на расстояние не является существенной проблемой, а вот строительство ГЭС в неподходящем месте может привести к серьезным техническим и экономическим проблемам.