Рассмотрим предложение:
«Лаборант геологической экспедиции прятал от дождя образцы минералов (1) а мы () покрытые брезентом (3) укладывали инструменты (4) и приборы в длинные ящики.»
На месте цифры (1) нужна запятая, так как начинается противопоставление с союзом «а».
Перед скобкой нужна запятая, так как начинается причастный оборот «покрытые брезентом».
На месте цифры (3) нужна запятая, так как заканчивается причастный оборот «покрытые брезентом».
На месте цифры (4) запятая не нужна, так как это конец предложения.
Ответ: 1, перед скобкой, 3.