4. Have John finished his project?

В пассивном залоге подлежащее подвергается действию, а не выполняет его. В данном случае нужно перестроить предложение так, чтобы акцент был на проекте, а не на Джоне.

Был ли его проект закончен Джоном?

Has his project been finished by John?

Ответ (EN):

1. Has his project been finished by John?

Перевод (RU):

1. Был ли его проект закончен Джоном?

Ответ: Has his project been finished by John?