Первая часть вопроса ("What ...?") требует глагола, обозначающего событие, которое произошло (What happened?). Вторая часть ("Why ... you ...?") спрашивает о причине чего-то, что происходит или произошло, и требует глагола в Present Continuous (Why are you crying?).
Наиболее логичная конструкция для данного вопроса: "What happened? Why are you crying?" Из предложенных вариантов, вариант a) has happened; are crying наиболее близок, если рассматривать "has happened" как вариант для "What's happened?" (сокращение от What has happened?). Однако, если строго следовать вариантам, то "happened" (Past Simple) для "What happened?" более вероятно. Но "are crying" для "Why you crying?" неверно, должно быть "Why are you crying?". Вариант "a" предлагает "are crying" как часть ответа, что делает его наиболее вероятным.
Ответ: a) has happened; are crying