Чтобы правильно соединить начало и конец предложений, нужно понять, о каком этапе развития Омской крепости идет речь в каждом случае.
1. Эволюция Омской крепости прошла путь...
Здесь речь идет о развитии крепости как населенного пункта, который становится более значимым. Вариант А описывает именно этот процесс: крепость развивается, приобретает статус города и становится важным административным центром.
2. В XIX веке Омская крепость, несмотря на свою военную историю и функции места ссылки,...
Этот вариант начинает предложение с описания прошлого крепости, но подразумевает, что она продолжала развиваться. Вариант Б описывает переход от простого укрепления к более крупной крепости, которая получила статус города, что соответствует дальнейшему развитию Омска.
Ответ: 1-А, 2-Б