В тексте говорится о самых маленьких живых организмах, состоящих из одной клетки, которые обитают повсеместно, в том числе в кишечнике и участвуют в пищеварении. Примером является кишечная палочка.
Кишечная палочка – это вид бактерий.
Следовательно, в тексте говорится о бактериях.