Основным последствием Флорентийской унии стало углубление раскола между русской и константинопольской церквями. Московская митрополия фактически стала независимой, что способствовало укреплению политической самостоятельности Московского княжества. В конечном итоге, это привело к установлению автокефалии Русской православной церкви в 1448 году.