По способу питания бактерии различают на автотрофов и гетеротрофов. Автотрофы способны самостоятельно синтезировать органические вещества из неорганических (например, фотосинтезирующие бактерии), а гетеротрофы получают органические вещества извне (например, бактерии-сапрофиты).