Это конструкция 'wish' для выражения сожаления о настоящем. Для сожалений о настоящем используется 'wish' + Past Simple. Форма 'not/be' в Past Simple - 'were' (или 'was' для первого лица, но 'were' более формально и общепринято в таких конструкциях).
Ответ: were not