Для выбора местоимения нужно учесть, что 'pen' — исчисляемое существительное в единственном числе, а 'pencils' — исчисляемое существительное во множественном числе.
Местоимение 'some' обычно используется с исчисляемыми существительными во множественном числе в утвердительных предложениях, а также с неисчисляемыми существительными. Например: 'I have some apples.'
Местоимение 'any' обычно используется с исчисляемыми существительными во множественном числе в вопросительных и отрицательных предложениях. Например: 'Do you have any questions?' или 'I don't have any money.'
В данном предложении 'I have got a pen and .... pencils.' мы имеем дело с исчисляемым существительным во множественном числе ('pencils'). Предложение является утвердительным. Поэтому более уместно использовать 'some'.