Число делится на 9, если сумма его цифр делится на 9:
\[3+1+Е+9=13+Е.\]
Наименьшее число, кратное 9 и не меньше 13, — 18. Поэтому \(13+Е=18\), откуда \(Е=5\).
Ответ: 5.